苗医学把气、血、水视为人体最重要的三种基本物质，决定着人体的健康和生命，用以阐释人体生理、对疾病进行辨别用药。

　　气，苗医称为“绞笨”，是指维持生命活动的精微物质，是人体能量的外在表现形式，分为四气：粹气、惠气、灵气、废气，分别在人体中发挥形成、运行、转化和排泄的作用，推动着机体的正常运行。如果气发生了病变，人体各项功能便会下降衰退，出现气虚（笨也洛乌）、气陷（按也洛乌）、倒气（挡乌也洛）或气逆（乌达）等。

　　血，是人体化五谷而得，濡养全身的精微物质，机体的各种生理活动都离不开血。苗医将其分为四血，分别为生血、熟血、瘀血和废血，四血分别在体内发挥着濡养转化、排泄等相应的功能。秒医学认为，血旺则体壮，血弱则生疾。

　　水，苗医称为“沃”，是组成人体必不可少的基础物质，分为四水：原水、汁水、精水、废水，在人体内分别具有摄入、运化、升华和排泄的作用，维持着人体的正常生理代谢。也有苗医将水分为真水和废水，真水是指存于体内的血中之血水、胆汁、胃液等，废水指排出体外的尿液、汗液、粪便等。苗医学认为，若机体出现水的代谢失常，则脏腑组织的功能就会相应的减弱或丧失。

　　苗医学认为，人体气、血、水三者之间是相互依存、互变互生、相互影响的。苗医学有“气血相互依存，气推血走，血带气行”之说。苗医诊断治病时，很注重神态的变化，两眼有神气病易治，两眼无神其病难治。血和水都是液态物质，相互化生。苗医学有“水生血，血带水，血水相融，血无水不能生，水无血不养人”之说。在诊疗疾病时，苗医通过辩病是在气、在血、在水、还是气血同在，遂用补气、补血、补水等方法进行治疗。